Das Fraunhofer IZM ist Teil der Fraunhofer-Gesellschaft. Die Fraunhofer-Gesellschaft gehört zu den großen, weltweit agierenden Forschungsorganisationen. Die Forschungsfelder der Fraunhofer-Gesellschaft richten sich nach den Bedürfnissen der Menschen: Gesundheit, Sicherheit, Kommunikation, Mobilität, Energie und Umwelt. Innerhalb der deutschen Forschungslandschaft fällt der Fraunhofer-Gesellschaft die Aufgabe zu, die Brücke zwischen der Grundlagenforschung und der industriellen Forschung und Entwicklung zu schlagen.

Die Forschungs- und Entwicklungsaktivitäten finden in den Fraunhofer-Instituten statt. Die Institute sind deutschlandweit verteilt. Ihr Standort befindet sich meist in attraktiven Universitätsstädten.

Fraunhofer-Institute agieren selbständig auf dem Markt und sind für den technisch-wissenschaftlichen wie auch für den wirtschaftlichen Erfolg selbst verantwortlich. Diese dezentrale Organisation wird durch zentrale Strukturen ergänzt. So sorgen sieben thematisch orientierte Verbünde für die fachliche Abstimmung, die Bündelung von Kernkompetenzen und das gemeinsame Auftreten am Markt. Das Fraunhofer IZM ist Mitglied des Fraunhofer-Verbundes Mikroelektronik, der die Kompetenzen von dreizehn Fraunhofer-Instituten mit ca. 2700 Mitarbeitern bündelt. Im Rahmen des Fraunhofer-Verbundes Mikroelektronik ist das Fraunhofer IZM der Ansprechpartner für alle Belange des Electronic Packaging.